data_A1IZ3
# 
_chem_comp.id                                    A1IZ3 
_chem_comp.name                                  "5-[2,4-bis(fluoranyl)phenoxy]-2-(cyclohexylmethyl)-~{N}-[2-[(3~{R})-3-(methoxymethyl)piperidin-1-yl]ethyl]indazole-6-carboxamide" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C30 H38 F2 N4 O3" 
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_chem_comp.pdbx_synonyms                         "2-(cyclohexylmethyl)-5-(2,4-difluorophenoxy)-N-(2-(3-(methoxymethyl)piperidin-1-yl)ethyl)-2H-indazole-6-carboxamide" 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2025-01-28 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2025-08-15 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        540.645 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     A1IZ3 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        9I47 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  PDBE 
_chem_comp.pdbx_pcm                              ? 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
A1IZ3 C01  C1  C 0 1 Y N N N N N -17.484 -39.250 -22.292 0.861   0.709  0.302  C01  A1IZ3 1  
A1IZ3 C03  C2  C 0 1 Y N N N N N -18.158 -40.773 -24.085 1.764   -1.510 -0.150 C03  A1IZ3 2  
A1IZ3 C04  C3  C 0 1 Y N N N N N -16.943 -41.442 -23.963 3.047   -1.075 -0.034 C04  A1IZ3 3  
A1IZ3 C05  C4  C 0 1 Y N N N N N -15.928 -41.045 -22.988 3.301   0.280  0.256  C05  A1IZ3 4  
A1IZ3 C06  C5  C 0 1 Y N N N N N -16.208 -39.937 -22.146 2.169   1.208  0.431  C06  A1IZ3 5  
A1IZ3 C08  C6  C 0 1 Y N N N N N -14.628 -41.484 -22.612 4.423   1.065  0.443  C08  A1IZ3 6  
A1IZ3 C10  C7  C 0 1 N N N N N N -12.848 -40.698 -20.815 4.875   3.449  0.954  C10  A1IZ3 7  
A1IZ3 C12  C8  C 0 1 N N N N N N -19.766 -38.861 -23.321 -0.703  -1.150 -0.120 C12  A1IZ3 8  
A1IZ3 C13  C9  C 0 1 Y N N N N N -19.488 -42.447 -25.187 2.592   -3.663 -0.476 C13  A1IZ3 9  
A1IZ3 C16  C10 C 0 1 N N N N N N -21.944 -38.156 -24.506 -3.120  -0.840 -0.099 C16  A1IZ3 10 
A1IZ3 C17  C11 C 0 1 N N N N N N -23.135 -39.004 -24.077 -4.121  0.297  0.122  C17  A1IZ3 11 
A1IZ3 C18  C12 C 0 1 Y N N N N N -19.004 -43.254 -26.229 3.209   -3.937 -1.687 C18  A1IZ3 12 
A1IZ3 C20  C13 C 0 1 Y N N N N N -20.289 -45.104 -25.473 4.766   -5.375 -0.567 C20  A1IZ3 13 
A1IZ3 C21  C14 C 0 1 Y N N N N N -20.839 -44.391 -24.388 4.152   -5.102 0.643  C21  A1IZ3 14 
A1IZ3 C22  C15 C 0 1 Y N N N N N -20.381 -43.073 -24.326 3.066   -4.247 0.692  C22  A1IZ3 15 
A1IZ3 C26  C16 C 0 1 N N N N N N -13.499 -43.451 -18.126 5.223   6.852  -0.813 C26  A1IZ3 16 
A1IZ3 C27  C17 C 0 1 N N N N N N -13.522 -42.755 -19.475 5.551   5.720  0.162  C27  A1IZ3 17 
A1IZ3 C28  C18 C 0 1 N N N N N N -13.756 -40.472 -18.479 3.134   5.097  0.255  C28  A1IZ3 18 
A1IZ3 C29  C19 C 0 1 N N N N N N -13.860 -41.077 -17.083 2.805   6.229  -0.721 C29  A1IZ3 19 
A1IZ3 C30  C20 C 0 1 N N N N N N -14.123 -42.605 -17.009 3.810   7.369  -0.537 C30  A1IZ3 20 
A1IZ3 C32  C21 C 0 1 N N N N N N -24.356 -38.608 -20.697 -7.169  -1.806 0.804  C32  A1IZ3 21 
A1IZ3 N09  N1  N 0 1 Y N N N N N -14.193 -40.633 -21.574 3.990   2.310  0.697  N09  A1IZ3 22 
A1IZ3 C02  C22 C 0 1 Y N N N N N -18.450 -39.621 -23.208 0.670   -0.629 0.015  C02  A1IZ3 23 
A1IZ3 C19  C23 C 0 1 Y N N N N N -19.384 -44.589 -26.391 4.294   -4.792 -1.731 C19  A1IZ3 24 
A1IZ3 C25  C24 C 0 1 N N N N N N -12.926 -41.327 -19.429 4.547   4.581  -0.021 C25  A1IZ3 25 
A1IZ3 C33  C25 C 0 1 N N N N N N -24.782 -40.085 -20.553 -8.229  -0.701 0.761  C33  A1IZ3 26 
A1IZ3 C34  C26 C 0 1 N N R N N N -23.650 -40.865 -21.061 -7.859  0.308  -0.329 C34  A1IZ3 27 
A1IZ3 C35  C27 C 0 1 N N N N N N -23.704 -40.708 -22.553 -6.466  0.874  -0.043 C35  A1IZ3 28 
A1IZ3 C36  C28 C 0 1 N N N N N N -23.272 -38.300 -21.786 -5.796  -1.179 1.058  C36  A1IZ3 29 
A1IZ3 C37  C29 C 0 1 N N N N N N -23.479 -42.284 -20.581 -8.880  1.447  -0.338 C37  A1IZ3 30 
A1IZ3 C39  C30 C 0 1 N N N N N N -21.215 -41.339 -20.282 -11.192 1.924  -0.756 C39  A1IZ3 31 
A1IZ3 F23  F1  F 0 1 N N N N N N -20.857 -42.279 -23.295 2.467   -3.981 1.873  F23  A1IZ3 32 
A1IZ3 F24  F2  F 0 1 N N N N N N -20.637 -46.381 -25.660 5.827   -6.210 -0.613 F24  A1IZ3 33 
A1IZ3 N07  N2  N 0 1 Y N N N N N -15.155 -39.713 -21.292 2.707   2.387  0.690  N07  A1IZ3 34 
A1IZ3 N14  N3  N 0 1 N N N N N N -20.657 -38.934 -24.416 -1.756  -0.322 0.035  N14  A1IZ3 35 
A1IZ3 N31  N4  N 0 1 N N N N N N -22.900 -39.460 -22.697 -5.488  -0.222 -0.013 N31  A1IZ3 36 
A1IZ3 O11  O1  O 0 1 N N N N N N -19.067 -41.168 -25.065 1.528   -2.817 -0.431 O11  A1IZ3 37 
A1IZ3 O15  O2  O 0 1 N N N N N N -20.116 -38.111 -22.428 -0.886  -2.325 -0.372 O15  A1IZ3 38 
A1IZ3 O38  O3  O 0 1 N N N N N N -22.061 -42.469 -20.610 -10.160 0.936  -0.716 O38  A1IZ3 39 
A1IZ3 H011 H1  H 0 0 N N N N N N -17.686 -38.405 -21.650 0.013   1.365  0.429  H011 A1IZ3 40 
A1IZ3 H041 H2  H 0 0 N N N N N N -16.743 -42.283 -24.611 3.867   -1.765 -0.164 H041 A1IZ3 41 
A1IZ3 H081 H3  H 0 0 N N N N N N -14.079 -42.310 -23.039 5.451   0.740  0.394  H081 A1IZ3 42 
A1IZ3 H101 H4  H 0 0 N N N N N N -12.142 -41.287 -21.419 4.732   3.797  1.977  H101 A1IZ3 43 
A1IZ3 H102 H5  H 0 0 N N N N N N -12.468 -39.672 -20.704 5.912   3.140  0.817  H102 A1IZ3 44 
A1IZ3 H162 H6  H 0 0 N N N N N N -21.877 -37.275 -23.851 -3.287  -1.621 0.642  H162 A1IZ3 45 
A1IZ3 H161 H7  H 0 0 N N N N N N -22.093 -37.829 -25.546 -3.255  -1.253 -1.099 H161 A1IZ3 46 
A1IZ3 H172 H8  H 0 0 N N N N N N -24.055 -38.403 -24.119 -3.986  0.710  1.122  H172 A1IZ3 47 
A1IZ3 H171 H9  H 0 0 N N N N N N -23.234 -39.873 -24.745 -3.953  1.078  -0.619 H171 A1IZ3 48 
A1IZ3 H181 H10 H 0 0 N N N N N N -18.309 -42.825 -26.935 2.842   -3.484 -2.596 H181 A1IZ3 49 
A1IZ3 H211 H11 H 0 0 N N N N N N -21.537 -44.817 -23.683 4.521   -5.558 1.551  H211 A1IZ3 50 
A1IZ3 H261 H12 H 0 0 N N N N N N -14.060 -44.394 -18.208 5.939   7.663  -0.682 H261 A1IZ3 51 
A1IZ3 H262 H13 H 0 0 N N N N N N -12.454 -43.668 -17.860 5.280   6.478  -1.836 H262 A1IZ3 52 
A1IZ3 H271 H14 H 0 0 N N N N N N -12.939 -43.355 -20.189 6.558   5.352  -0.034 H271 A1IZ3 53 
A1IZ3 H272 H15 H 0 0 N N N N N N -14.565 -42.689 -19.817 5.494   6.093  1.185  H272 A1IZ3 54 
A1IZ3 H281 H16 H 0 0 N N N N N N -14.769 -40.367 -18.894 3.076   5.471  1.277  H281 A1IZ3 55 
A1IZ3 H282 H17 H 0 0 N N N N N N -13.288 -39.480 -18.399 2.418   4.286  0.124  H282 A1IZ3 56 
A1IZ3 H292 H18 H 0 0 N N N N N N -12.914 -40.875 -16.560 2.862   5.856  -1.743 H292 A1IZ3 57 
A1IZ3 H291 H19 H 0 0 N N N N N N -14.684 -40.570 -16.560 1.798   6.598  -0.524 H291 A1IZ3 58 
A1IZ3 H302 H20 H 0 0 N N N N N N -13.726 -42.969 -16.050 3.753   7.742  0.485  H302 A1IZ3 59 
A1IZ3 H301 H21 H 0 0 N N N N N N -15.212 -42.761 -17.037 3.576   8.175  -1.232 H301 A1IZ3 60 
A1IZ3 H321 H22 H 0 0 N N N N N N -25.254 -38.023 -20.944 -7.404  -2.505 1.607  H321 A1IZ3 61 
A1IZ3 H322 H23 H 0 0 N N N N N N -23.958 -38.278 -19.726 -7.157  -2.335 -0.149 H322 A1IZ3 62 
A1IZ3 H191 H24 H 0 0 N N N N N N -18.991 -45.193 -27.195 4.774   -5.006 -2.675 H191 A1IZ3 63 
A1IZ3 H251 H25 H 0 0 N N N N N N -11.905 -41.398 -19.025 4.604   4.207  -1.044 H251 A1IZ3 64 
A1IZ3 H332 H26 H 0 0 N N N N N N -24.976 -40.329 -19.498 -9.202  -1.138 0.538  H332 A1IZ3 65 
A1IZ3 H331 H27 H 0 0 N N N N N N -25.686 -40.285 -21.148 -8.268  -0.197 1.727  H331 A1IZ3 66 
A1IZ3 H341 H28 H 0 0 N N N N N N -22.743 -40.332 -20.738 -7.858  -0.188 -1.299 H341 A1IZ3 67 
A1IZ3 H351 H29 H 0 0 N N N N N N -23.238 -41.559 -23.072 -6.194  1.582  -0.825 H351 A1IZ3 68 
A1IZ3 H352 H30 H 0 0 N N N N N N -24.734 -40.577 -22.915 -6.471  1.382  0.922  H352 A1IZ3 69 
A1IZ3 H361 H31 H 0 0 N N N N N N -23.651 -37.483 -22.418 -5.805  -0.661 2.017  H361 A1IZ3 70 
A1IZ3 H362 H32 H 0 0 N N N N N N -22.359 -37.971 -21.269 -5.037  -1.962 1.074  H362 A1IZ3 71 
A1IZ3 H372 H33 H 0 0 N N N N N N -23.872 -42.406 -19.561 -8.944  1.887  0.657  H372 A1IZ3 72 
A1IZ3 H371 H34 H 0 0 N N N N N N -23.983 -42.992 -21.255 -8.568  2.209  -1.053 H371 A1IZ3 73 
A1IZ3 H393 H35 H 0 0 N N N N N N -20.159 -41.639 -20.349 -12.132 1.457  -1.050 H393 A1IZ3 74 
A1IZ3 H391 H36 H 0 0 N N N N N N -21.408 -40.519 -20.989 -11.303 2.374  0.231  H391 A1IZ3 75 
A1IZ3 H392 H37 H 0 0 N N N N N N -21.436 -41.001 -19.259 -10.928 2.696  -1.479 H392 A1IZ3 76 
A1IZ3 H141 H38 H 0 0 N N N N N N -20.419 -39.538 -25.176 -1.610  0.615  0.236  H141 A1IZ3 77 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
A1IZ3 C01 C02  DOUB Y N 1  
A1IZ3 C02 C03  SING Y N 2  
A1IZ3 C03 C04  DOUB Y N 3  
A1IZ3 C04 C05  SING Y N 4  
A1IZ3 C05 C06  SING Y N 5  
A1IZ3 C01 C06  SING Y N 6  
A1IZ3 C08 N09  SING Y N 7  
A1IZ3 N07 N09  SING Y N 8  
A1IZ3 N07 C06  DOUB Y N 9  
A1IZ3 C05 C08  DOUB Y N 10 
A1IZ3 N09 C10  SING N N 11 
A1IZ3 C03 O11  SING N N 12 
A1IZ3 C02 C12  SING N N 13 
A1IZ3 O11 C13  SING N N 14 
A1IZ3 C12 N14  SING N N 15 
A1IZ3 C12 O15  DOUB N N 16 
A1IZ3 N14 C16  SING N N 17 
A1IZ3 C16 C17  SING N N 18 
A1IZ3 C18 C19  DOUB Y N 19 
A1IZ3 C19 C20  SING Y N 20 
A1IZ3 C20 C21  DOUB Y N 21 
A1IZ3 C21 C22  SING Y N 22 
A1IZ3 C13 C18  SING Y N 23 
A1IZ3 C13 C22  DOUB Y N 24 
A1IZ3 C22 F23  SING N N 25 
A1IZ3 C20 F24  SING N N 26 
A1IZ3 C10 C25  SING N N 27 
A1IZ3 C26 C27  SING N N 28 
A1IZ3 C28 C29  SING N N 29 
A1IZ3 C29 C30  SING N N 30 
A1IZ3 C26 C30  SING N N 31 
A1IZ3 C27 C25  SING N N 32 
A1IZ3 C25 C28  SING N N 33 
A1IZ3 C17 N31  SING N N 34 
A1IZ3 C32 C33  SING N N 35 
A1IZ3 C33 C34  SING N N 36 
A1IZ3 C34 C35  SING N N 37 
A1IZ3 C32 C36  SING N N 38 
A1IZ3 C35 N31  SING N N 39 
A1IZ3 N31 C36  SING N N 40 
A1IZ3 C34 C37  SING N N 41 
A1IZ3 C37 O38  SING N N 42 
A1IZ3 O38 C39  SING N N 43 
A1IZ3 C01 H011 SING N N 44 
A1IZ3 C04 H041 SING N N 45 
A1IZ3 C08 H081 SING N N 46 
A1IZ3 C10 H101 SING N N 47 
A1IZ3 C10 H102 SING N N 48 
A1IZ3 C16 H162 SING N N 49 
A1IZ3 C16 H161 SING N N 50 
A1IZ3 C17 H172 SING N N 51 
A1IZ3 C17 H171 SING N N 52 
A1IZ3 C18 H181 SING N N 53 
A1IZ3 C21 H211 SING N N 54 
A1IZ3 C26 H261 SING N N 55 
A1IZ3 C26 H262 SING N N 56 
A1IZ3 C27 H271 SING N N 57 
A1IZ3 C27 H272 SING N N 58 
A1IZ3 C28 H281 SING N N 59 
A1IZ3 C28 H282 SING N N 60 
A1IZ3 C29 H292 SING N N 61 
A1IZ3 C29 H291 SING N N 62 
A1IZ3 C30 H302 SING N N 63 
A1IZ3 C30 H301 SING N N 64 
A1IZ3 C32 H321 SING N N 65 
A1IZ3 C32 H322 SING N N 66 
A1IZ3 C19 H191 SING N N 67 
A1IZ3 C25 H251 SING N N 68 
A1IZ3 C33 H332 SING N N 69 
A1IZ3 C33 H331 SING N N 70 
A1IZ3 C34 H341 SING N N 71 
A1IZ3 C35 H351 SING N N 72 
A1IZ3 C35 H352 SING N N 73 
A1IZ3 C36 H361 SING N N 74 
A1IZ3 C36 H362 SING N N 75 
A1IZ3 C37 H372 SING N N 76 
A1IZ3 C37 H371 SING N N 77 
A1IZ3 C39 H393 SING N N 78 
A1IZ3 C39 H391 SING N N 79 
A1IZ3 C39 H392 SING N N 80 
A1IZ3 N14 H141 SING N N 81 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
A1IZ3 InChI            InChI                1.06  "InChI=1S/C30H38F2N4O3/c1-38-20-22-8-5-12-35(17-22)13-11-33-30(37)25-16-27-23(19-36(34-27)18-21-6-3-2-4-7-21)14-29(25)39-28-10-9-24(31)15-26(28)32/h9-10,14-16,19,21-22H,2-8,11-13,17-18,20H2,1H3,(H,33,37)" 
A1IZ3 InChIKey         InChI                1.06  OJJHRKPNNTZEQJ-UHFFFAOYSA-N                                                                                                                                                                                  
A1IZ3 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "COC[C@@H]1CCCN(CCNC(=O)c2cc3nn(CC4CCCCC4)cc3cc2Oc5ccc(F)cc5F)C1"                                                                                                                                            
A1IZ3 SMILES           CACTVS               3.385 "COC[CH]1CCCN(CCNC(=O)c2cc3nn(CC4CCCCC4)cc3cc2Oc5ccc(F)cc5F)C1"                                                                                                                                              
A1IZ3 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "COC[C@@H]1CCCN(C1)CCNC(=O)c2cc3c(cc2Oc4ccc(cc4F)F)cn(n3)CC5CCCCC5"                                                                                                                                          
A1IZ3 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "COCC1CCCN(C1)CCNC(=O)c2cc3c(cc2Oc4ccc(cc4F)F)cn(n3)CC5CCCCC5"                                                                                                                                               
# 
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id           A1IZ3 
_pdbx_chem_comp_identifier.type              "SYSTEMATIC NAME" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program           "OpenEye OEToolkits" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version   2.0.7 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier        "5-[2,4-bis(fluoranyl)phenoxy]-2-(cyclohexylmethyl)-~{N}-[2-[(3~{R})-3-(methoxymethyl)piperidin-1-yl]ethyl]indazole-6-carboxamide" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
A1IZ3 "Create component" 2025-01-28 PDBE 
A1IZ3 "Initial release"  2025-08-20 RCSB 
# 
_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal      1 
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id      A1IZ3 
_pdbx_chem_comp_synonyms.name         "2-(cyclohexylmethyl)-5-(2,4-difluorophenoxy)-N-(2-(3-(methoxymethyl)piperidin-1-yl)ethyl)-2H-indazole-6-carboxamide" 
_pdbx_chem_comp_synonyms.provenance   AUTHOR 
_pdbx_chem_comp_synonyms.type         ? 
# 
